1. 拌料

灵芝工厂化栽培需要培养基标准化，便于发菌、出芝管理，一般不使用段木，使用木屑(南方称木糠)、棉子壳、玉米芯、甘蔗渣等原料，辅料有米糠、麸皮、玉米粉、黄豆粉、石膏粉、石灰粉等。木屑一般使用阔叶树木屑，针叶树(杉、松、樟树、桉树等)木屑不能用于灵芝栽培，即使掺杂有针叶木屑，也不能超过10%；棉子壳应选择无杂色、不结块、无污染和虫害的干料；甘蔗渣不能发霉，甘蔗渣和玉米芯都要事先粉碎成屑使用。用搅拌机将主要原料及辅料、水分等搅拌均匀，料含水量60%～65%，用手捏料无水滴出，手指缝间可见到水即可，pH控制在6.5～7.5。灵芝工厂化栽培培养基参考配方：木屑54%，棉子壳32%，麸皮12%、石灰粉2%；木屑74%，玉米芯粉24%，石膏粉1%，蔗糖1%；木屑50%，甘蔗渣35%，麸皮12%，豆粕2%，石膏粉1%。

2. 装袋

使用装袋机进行培养料装袋，装料袋采用耐高温的聚丙烯塑料袋(规格35厘米×20厘米)，每袋约装1500克。装袋后，袋口套上专用通气套环，并检查料袋有没有出现破孔，如有就需用不干胶布封好，以防灭菌后再被杂菌感染。检查料袋后，装在专用料袋周转框内并堆叠在专用灭菌推车上，待灭菌。

3. 灭菌

将装满料袋的货架车平行推入高压灭菌炉内进行灭菌。当炉内压力升到0.05兆帕时，排冷气，后重新升至121℃、0.15兆帕时，灭菌2～2.5小时。灭菌结束后，待压力下降到0时打开炉门，拉出货架车至冷却间冷却。也可以用常压灭菌，100℃灭菌时间8～10小时。冷却间在灭菌前后必须进行空间消毒30分钟以上。

4. 接种

接种须在无菌接种室内进行，接种前，接种室内地面先用3%～5%的消毒水拖洗一次，再打开室内紫外灯及臭氧发生器进行空间消毒灭菌半小时以上。菌种可采用液体菌种，也可以固体菌种。接种时把一框框的料袋传送到接种生产线上进行接种，接种后套上封口套环，再把堆叠成幢的培养包转移至培养房内进行菌丝培养。

5. 菌丝培养

培养房在培养包进入培养前要进行彻底的清洁、消毒工作，清洁完地面和墙壁后，再用无菌室专用烟雾消毒杀菌剂(主要有效成分为二氯异氰，尿酸钠)进行空间消毒，按3克/立方米用量，用明火点燃后马上关闭房门24小时，再强制通风1小时。然后把接种后堆叠成幢的培养包摆放在培养房内，按不同的生长阶段控制培养房内温度在25～27℃，空气相对湿度55%～70%。每天自然通风1～2小时，开排气扇通风15～30分钟，保持房内空气新鲜。进出培养室随手关门、灯，尽量减少光源。在菌丝培养期间要翻袋大检三次。第一次菌丝长满袋肩，第二次菌丝长满料面1/2，第三次菌丝全部长满。发现有杂菌感染立即处理，如发现真菌孢子的，要用75%酒精的湿毛巾轻轻包住移至室外小心处理，避免孢子飞散。如果发现橘黄色孢子的链孢霉，立即烧毁或深埋，而且房间要全面检查消毒。

6. 出芝管理

当培养袋内长满白色菌丝，袋口出现白色块状原基时，需及时将堆叠成幢的培养包摆放在出芝房内。出芝房要求提前做好清洗、消毒工作，防止杂菌感染，并能通风，并有一定散射光。整幢的培养包排放到出芝房内，打开套环封口盖。按不同的生长阶段，通过温湿度、空气质量智能监控系统控制栽培房内温度在25～28℃，空气相对湿度在85%～95%，空气相对湿度不足需加湿，加湿方法有超声波雾化加湿以及喷雾加湿。出芝阶段氧气消耗比较大，需要经常通风，出原基期每天通风2小时，灵芝开盖以后每天通风6小时以上。控制好室内二氧化碳含量，原基形成及长柄期适当减少通风增加二氧化碳含量，把菌柄延长到3～5厘米，确保以后喷粉时菌盖下有足够的空间，但二氧化碳含量不能超过3%，以免长成鹿角芝；菌盖形成期则不能超过0.1%，否则会形成畸形芝。适时疏蕾，用锋利洁净的刀片切去多余较弱小的分蕾，只留一枝健壮的蕾。以保证灵芝的质量。发现有杂菌立即处理，特别注意如果发现橘黄色孢子的链孢霉时，立即烧毁或深埋感染袋，而且房间要全面检查消毒。

在灵芝子实体生长过程中，要注意对虫害的防治，灵芝培养间门窗及通风口需要安装细密窗纱，防止害虫侵入。发现害虫时，可用诱捕的方法，切不可直接在灵芝子实体上喷洒药物。

7. 灵芝采收

灵芝菌盖边缘白边不再增大开始大量喷粉时，停止加湿，开始盖收粉罩。盖好收粉罩后，可以在栽培室一头用鼓风机套布袋收集悬浮在空气中的孢子粉，也可以每棵灵芝单独用白纸做成罩罩住灵芝，收集孢子粉，灵芝孢子粉收集时间大约15～20天。

采收时把收粉罩一个个轻轻取下，把子实体上的孢子粉轻轻刷入收粉箱内。一手握住菌柄或菌盖边缘用刀片从菌柄基部切下，菌盖底部避免粘上孢子粉，以免沾污菌盖底部原有的色泽。

8. 灵芝烘干包装

直接用烘炉烘干，入烘炉时子实体单个盖朝上排列在烘炉架上，烘干时先35℃低温并通风使水分尽快散发，然后逐渐提高温度(每升高5℃保持1～2小时)，最后升温至60℃烘至恒重。烘干后灵芝子实体含水量在12%以下；感官测定时，手捏菌盖与菌柄交界处无软绵，菌盖相互碰撞有清脆的响声，芝盖棕褐色。

烘干后灵芝孢子粉含水量在8%以下，感官测定时，手握粉能向指缝间喷射出来，手指磨擦孢子粉“嚓嚓”作响，无结块、无杂质。

灵芝子实体及孢子粉经质检员检验确认烘干后，停炉让其自然降至常温，然后按规格、标准，分级分类包装。