多发生在生长前期，为害亚麻、胡麻的各部位。幼苗染病根茎部现褐色至深褐色凹陷的条斑。茎叶染病叶上生褐色圆形有轮纹的病斑，严重的病苗或植株枯死。

Colletotrichum lini(Wester.)Tochinai  称亚麻炭疽菌，属真菌界半知菌类。分生孢子盘上刚毛具3个隔膜，不分枝，黑褐色。分生孢子盘黑褐色。分生孢子梗短条状，单胞无色。分生孢子直或略弯，圆筒形至近梭形。附着孢大小10～13.5×6.5～13.5(微米)，变化幅度大。该菌有生理分化现象，已知有7个生理小种，其中小种3C和小种1最普遍。

以分生孢子盘或菌丝在病残体及种子上越冬。翌春种子带菌先侵染幼苗，后在田间循环侵染，传播蔓延。阴湿条件下易流行。偏施过施氮肥、密度大的连作田发病重。

1. 合理轮作。

2. 播种前种子进行药剂拌种。由于亚麻种子遇水易变黏，选用药剂时，以粉剂为宜。主防炭疽病兼防枯萎病时选用25％多菌灵可湿性粉剂或50％苯菌灵可湿性粉剂、80％炭疽福美可湿性粉剂、60％多福混剂，药量为种子种量的0.2％～0.3％，拌后播种，可兼治多种根部病害。

3. 改善麻田生态条件，雨后及时开沟排水。

4. 发病初期喷洒40％多·福·溴菌(炭疽清)可湿性粉剂600倍液或80％福·福锌(炭疽立克)可湿性粉剂800倍液、50％福·异菌(灭霉灵)可湿性粉剂800倍液、25％阿米西达悬浮剂1500倍液。