病原菌为链格孢Alternaria alternata （Fr.）Keissler.，属半知菌亚门真菌。
病原菌以菌丝体随病残体在土壤中或种子上越冬，第2年春天西瓜出苗后，遇适宜温度、湿度时，借风雨传播即可进行初侵染，后病部又产生分生孢子，通过风雨传播，进行多次重复侵染，引起病害不断发展。
（1）栽培措施。收获后清除病残体，集中深埋或烧毁。露地栽培的西瓜在雨后要特别注意开沟排水，防止湿气滞留。
（2）药剂防治。在发病前未见病斑时开始喷药，常用药剂有50%速克灵可湿性粉剂1 500倍液，50%扑海因可湿性粉剂1 000倍液，75%百菌清可湿性粉剂600倍液，70%代森锰锌可湿性粉剂或干悬粉500倍液，80%大生或80%喷克可湿性粉剂600倍液。每隔7～10天防治1次，连续防治3～4次。