（1）种子处理。播种前种子用20%使百克乳油4000倍液，50%多菌灵可湿性粉剂1000倍液，浸种30～40分钟，或用10%漂白粉浸种10分钟，取出后用0.1%～0.15%的50%苯菌灵可湿性粉剂拌种。
（2）栽培措施。选用抗病品种；用南瓜或葫芦作砧木嫁接，这是目前防止枯萎病蔓延最有效的方法；避免重茬，水旱轮作3～5年，旱地轮作5～8年；土壤呈酸性，每667平方米施100千克石灰改土；适当控制浇水，禁用大水漫灌，增施磷、钾肥，在幼苗期、伸蔓期和结果初期各进行1次叶面施肥。
（3）药剂防治。播种前或定植前用50%的多菌灵或70%的甲基托布津药土（药、土比例为1︰100），沟施或穴施进行土壤消毒。苗床用治枯灵2000倍液分别在二叶期、三叶期各喷1次。定植时用10%的双效灵500倍液500毫升灌穴，然后定植、覆土。座果初期开始喷药，常用药剂有10%双效灵水剂200倍液，50%苯菌灵可湿性粉剂800～1000倍液，40%多·硫悬浮剂500～600倍液，40%拌种双粉剂300倍悬浮液加黄腐酸4000倍液，20%甲基立枯磷乳油900～1000倍液，36%甲基硫菌灵悬浮剂400～500倍液，50%多菌灵可湿性粉剂1000倍液加15%三唑酮可湿性粉剂4000倍液。每隔10天左右防治1次，共防2～3次。植株发病后及时用药剂灌根，药剂有40%的瑞毒霉400倍液，80%的代森锌3000倍液， 75%的百菌清1000倍液，并应减少肥水供应。此外，也可用药肥兼用杀菌剂高锰酸钾600～800倍液分别在苗期，伸蔓期和坐果期各喷洒1次。